ADAPTS (ANALYSE DE LA DIVERSITÉ, L’ASSYMÉTRIE DES ARBRES PHYLOGÉNÉTIQUES, ET LA SURVIVANCE): UN NOUVEAU LOGICIEL POUR L’ANALYSE DES DONNÉES RELATIFS À LA PORTÉE STRATIGRAPHIQUE

Alistair J. McGowan and Paul N. Pearson

Résumé

Afin d’automatiser l’analyse des données relatives à la portée stratigraphique, un nouveau logiciel fut développé: ADAPTS (analyse de la diversité, l’assymétrie des arbres phylogénétiques, et la survivance). ADAPTS exécute trois sortes d’analyses: des métriques taxonomiques relatives au taux de l’évolution, des analyses de survivance, et des tests pour des biais dans les taux de spéciation et d’extinction entre les ancêtres et les descendants, ce qui devrait prendre la forme de branchages assymétriques dans l’arbre phylogénétique. Pour ces tests, ADAPTS n’a besoin que cinqs informations au sujet de chaque taxon: un numéro d’identification (ID), une date de première apparition (FAD) et dernière apparition (LAD) du taxon, sa portée stratigraphique, et le numéro d’identification (ID) de son ancêtre. Ces données sont entrés à l’aide de n’importe quel logiciel de feuille de calcul, et ADAPTS les lit, et inscrit les résultats dans une feuille de calcul. Pour tester la performance d’ADAPTS, une phylogénie aléatoire fut construite avec TREE GROWTH, et le produit anyalysé par ADAPTS. Ce test confirme qu’ADAPTS est capable de détecter un signal aléatoire connu et d’analyser rapidement une grand nombre de données.

MOTS CLÉS: portée stratigraphique, survivance, taux d’évolution